湿地水文通常是指湿地的入流与出流以及与其它生境因素的相互用等。水文周期或水文特征是湿地人流与出流水量平衡水量预算、湿地区域的地形、地貌和地层条件对水文过程综合影响的结果。水文影响湿地物种组成、主要生产量、有机物沉积和营养物的循环等。湿地水文产生独特的物理化学条件,使之产生一个独特的不同于陆地系统和深水水生系统的生态系统。湿地通过水文过程如降雨、地表径流、地下水、潮流、河流与洪水等进行能量和营养物交换。水深、水流形式、淹没程度和洪水频率这些都是水文输人和输出的结果, 是土壤的生物化学特性和湿地最终生物种类选择的主要影响因素。从微生物到植被和水禽都受水文的控制和影响, 当水文状况每年保持相似的情况下, 则湿地将会长期维持其生态结构和完整的功能当水文状况变化时, 则导致湿地类型、过程和收稿功能的变化。

湿地生物对湿地水文的影响是通过湿地的生物变化影响环境的水文和化学过程。特别地, 微生物促进湿地土壤的化学变化, 影响植物对营养物的利用,甚至化合物如硫化物的生成。植物通过炭的形成、沉淀物的堆积、营养物的贮留、水的覆盖和蒸发等而引起物理环境的变化。沉积的沉淀物和有机物阻碍水流而最终减少湿地的淹没程度和洪水频率。植物种类的改变, 引起进人湿地水量、土壤结构、渗透、蒸发等的变化, 进而引起水文状态的变化川。湿地动物对湿地水文的改变和变化有显著的影响, 如海狸筑坝阻挡水而使水流经大片面积, 在原来没有湿地的地方形成湿地。赓香鼠、鹅类和鳄类等湿地动物, 因自己生存和其它生物的生存环境的变化而影响生态系统的水文和其它物理特性变化。