1库容减少，水库兴利效益降低

库容是水库除害兴利的基本条件，但因泥沙淤积库容减少，使水库原定兴利目标不能实现。有些水库为减缓淤积，延长水库使用寿命，不得不把水库运用方式由“蓄洪运用”改为“蓄清排挥”运用。这样，水库的兴利效益虽有所降低，但却可以长期保持一部分库容。

2水库淤积末端向上游延伸，造成回水末端地区淹没、浸没损失扩大

在多泥沙河流水库上，由于泥沙淤积剧烈，往往在回水末端上游也发生淤积，这就是水库淤积上延问题，即“翘尾巴淤积’心。

3污染水质

泥沙是有机和无机污染物的载体，沉积在库区的泥沙对水质影响很大。

4阻碍航运

在多沙河流通航河道上修建水库后，由于水库回水变动区泥沙的淤积，常因航深、航宽不足而影响通航.特别是一些大型水库因水库水位变幅大，使回水变动区的河势处于一种不稳定状态，对航行不利。

5坝区泥沙淤积

坝区泥沙淤积是指大坝或枢纽工程附近河段的淤积，包括电站进水口、上下游引航道及船闸闸室的淤积等.坝前泥沙淤积有可能堵塞闸孔，威胁工程安全.此外，从水库排出的淤沙颗粒较粗，从而加重了泥沙对泄流建筑物及水轮机过流部件的磨蚀。

6对水库下游河道的影响

在多沙河流上修建水库后，改变了水库下游河道自然的来水来沙条件，下游河道的冲淤直接受水库调节的影响一般蓄洪运用水库，库区泥沙淤积，出库为清水.清水会使下游河道发生长距离冲刷。